ENTREVISTA SONJA HANSEN
La Dra. Sonja Hansen ha dedicado toda su vida profesional a la ciencia y a la investigación. Doctora en Microbiología Molecular por la Northeastern University (Boston), ha trabajado como investigadora en diferentes instituciones de investigación de Estados Unidos y Alemania, y es ahora la directora de proyectos de la UE en el Centro Max Delbrück (MDC) de Medicina Molecular de la Asociación Helmholtz.
Sonja es una de las personas que hicieron posible el proyecto CORBEL, el cual representó el comienzo de una era en la comunidad científica. Un proyecto de clúster financiado por la Comisión Europea que reunía las Infraestructuras de Investigación en Ciencias de la Vida (LS RI). La misión del proyecto era apoyar la ciencia de vanguardia ofreciendo acceso a las últimas tecnologías, colecciones completas de recursos y experiencia técnica. El proyecto CORBEL finalizó en mayo de 2020, pero las instituciones de investigación en ciencias de la vida continúan trabajando juntas para ofrecer acceso a investigadores en los ámbitos académico e industrial.
Cada vez más a menudo, el mercado de los cosméticos exige desarrollos tecnológicos de vanguardia. La aplicación de herramientas bioinformáticas, estadísticas y métodos de aprendizaje automático es un requisito previo para la investigación biomédica actual basada en datos. Los análisis computacionales de grandes conjuntos de datos en experimentos de alto rendimiento pueden ayudar a abrir nuevas vías y objetivos en biología de la piel.
Dra. Hansen, entendemos que el objetivo fundamental de proyectos clúster como CORBEL es poner en contacto a sus usuarios con las 13 infraestructuras de investigación biomédica y biológica que cooperan y participan en este proyecto, para lograr una comunicación y una difusión más sólidas dentro de la comunidad científica. Sin embargo, ¿cómo está contribuyendo al desarrollo científico o tecnológico de las empresas privadas? ¿Podría hablarnos de las posibles aplicaciones del proyecto para la industria?
Las convocatorias abiertas de CORBEL adaptaron los requisitos sobre publicación y derechos de propiedad intelectual específicamente para atraer solicitudes de pymes y de la industria. Debido a la naturaleza interdisciplinaria de CORBEL, recibimos ideas de proyectos muy innovadores, que no solo impulsaron el desarrollo tecnológico en las infraestructuras de investigación, sino que también dieron como resultado adelantos científicos. Nuestras LS RI ofrecen acceso a tecnologías como el cribado químico y la obtención de imágenes y recursos avanzados, entre ellos los biobancos, que son de gran interés para la industria y las pymes.
Para facilitar la colaboración con la industria, nuestro portal de ayuda a la innovación ofrece asesoramiento de asociación y fácil acceso a herramientas y recursos para la colaboración.
Estas infraestructuras de investigación cuentan con los equipos más talentosos y los conocimientos más especializados de toda Europa. Estos servicios centrales son necesarios para compartir los costes de los equipos y reactivos extraordinariamente costosos que generan los macrodatos necesarios para las ciencias ómicas (genómica, transcriptómica, metabolómica, etc.). Hasta donde sabemos, este es el camino habitual para que los grupos de investigación líderes dentro del mundo académico maximicen sus esfuerzos, pero nosotros nos preguntamos: ¿es posible que las empresas privadas también se beneficien de estas infraestructuras? ¿Cómo puede una persona de la industria acceder a estos servicios?
Sí, nuestras infraestructuras de investigación están abiertas a la industria y las pymes. Visitando nuestro sitio web Lifescience-RI, pueden obtener más información sobre las modalidades de acceso a cada infraestructura, así como sobre las oportunidades de financiación.
El equipo de I+D de Provital ha hecho uso de dos de sus infraestructuras hasta ahora: la secuenciación de nueva generación en la Academia de Ciencias de Atenas y la Plataforma de Bioinformática del Instituto de Biología de Sistemas Médicos de Berlín (BIMSB) del MDC-Berlín, que fueron muy útiles en algunos nuestros desarrollos. Esto muestra cómo la industria cosmética también puede capitalizar las infraestructuras científicas. Sin embargo, nosotros somos proveedores de ingredientes activos, por lo que nuestros clientes son los fabricantes del producto final. ¿Cuáles de sus servicios/infraestructuras cree que ellos podrían aprovechar al máximo?
Nuestras infraestructuras médicas para ensayos clínicos ECRIN, la medicina traslacional EATRIS y los biobancos BBMRI pueden ser de especial interés.
La investigación de nuevos cosméticos también puede beneficiarse enormemente de las oportunidades que ofrecen las infraestructuras de investigación biológica. Permítanme resaltar el ejemplo de UE-OPENSCREEN. Las LS RI, centrándose en la biología química, brindan acceso a un cribado de alto contenido y alto rendimiento que incluye una variedad de tecnologías de lectura y una gran experiencia en modelos celulares complejos. Las colecciones de compuestos naturales se pueden aprovechar para abordar la creciente demanda de productos naturales activos en la industria cosmética.
Creo que existen más aplicaciones potenciales, por ejemplo, las imágenes avanzadas, incluidas las tecnologías de imágenes en vivo y de alto rendimiento en Euro-BioImaging, las imágenes biomoleculares y el análisis estructural 3D en Instruct.
Sería genial si pudiera darnos una vista previa del camino que probablemente tomarán las tendencias técnicas en los próximos años. ¿Existe alguna infraestructura que, como Euro-BioImaging, por ejemplo, permita un uso potencial en las prácticas de investigación y desarrollo de cosméticos?
Provital accedió a nuestras infraestructuras de investigación para obtener datos masivos de expresión génica en células de la piel. Ahora podemos dar un gran paso más y realizar análisis multiómicos a nivel de una sola célula. Los desarrollos recientes en la transcriptómica espacial y en la secuenciación in situ proporcionan una resolución espacial adicional. Estas tecnologías las ofrece el consorcio europeo de infraestructuras EASI-Genomics . En MDC estamos coordinando las convocatorias de acceso. ¡Estaré encantada de proporcionar más información!
El ámbito de las imágenes también está experimentando grandes avances en una amplia variedad de aplicaciones potenciales para su industria. Euro-BioImaging es una infraestructura de investigación que brinda acceso a tecnologías de imágenes a usuarios académicos e industriales, con un enfoque específico en tecnologías de vanguardia. Una de las áreas donde los nuevos desarrollos tecnológicos pueden ser relevantes para su industria son los enormes avances en criomicroscopía electrónica, que permiten una investigación mucho más detallada de la ultraestructura celular y las interacciones entre proteínas y moléculas pequeñas. Por otro lado, los avances en microscopía de lámina de luz, combinados con los cultivos de organoides, pueden permitir la obtención de imágenes de procesos celulares para dar respuesta a varios tratamientos diferentes en un contexto complejo y bio-realista.
Al mismo tiempo, muchos avances de investigación nuevos continúan produciendo conjuntos de datos muy grandes y la computación en la nube y los recursos se vuelven más importantes para muchos proyectos de investigación. Grandes proyectos de clústeres, como el European Open Science Cloud for the Life Sciences (EOSC-Life), pueden servir para poner en contacto a investigadores, tanto del mundo académico como de la industria, con recursos compartidos en la nube, lo que permite compartir y reutilizar datos, herramientas y flujos de trabajo en la nube.
Provital está utilizando las tecnologías más avanzadas para el estudio de la biología de la piel, incluso dentro del ámbito de la investigación básica. Con la ayuda de CORBEL y las LS-RI europeas, hemos podido secuenciar todo el transcriptoma de dos tipos de células de la piel, lo que nos ha permitido estudiar el impacto que ejercen varios compuestos naturales en el conjunto de estas células. Es decir, no solo hemos explorado algunos genes que seleccionamos de acuerdo con nuestros intereses, sino todos ellos (hasta 25.000), lo que nos ha llevado a descubrimientos de vanguardia inesperados y muy emocionantes. Hasta donde sabemos, Provital es la única empresa privada del sector cosmético que se ha beneficiado del proyecto CORBEL. ¿Es eso realmente así? ¿Podría darnos otro ejemplo del desarrollo de un cosmético o de un avance técnico surgido del uso de CORBEL o las LS-RI europeas?
¡Así es! Provital es nuestro primer usuario industrial del sector cosmético. La empresa obtuvo acceso a nuestras tecnologías a través de una convocatoria abierta de CORBEL. El término «acceso» significa varios tipos diferentes de acceso, tanto físico como remoto o virtual. En el caso del proyecto Provital, Miguel Aso envió algunas muestras a nuestra plataforma de secuenciación NGS de BRFAA en Atenas. También habría sido posible visitar las instalaciones y recibir formación in situ, si lo hubieran deseado. Los datos de secuenciación se compartieron con la plataforma de bioinformática de MDC, donde se analizaron y se enviaron de vuelta a Provital. La subvención de CORBEL proporcionó la experiencia técnica, las horas de personal, el tiempo de uso de los instrumentos y los consumibles. Los usuarios también tuvieron la oportunidad de conocer otros proyectos interdisciplinarios de la convocatoria abierta de CORBEL y las tecnologías y servicios a los que habían accedido nuestros usuarios en varios eventos del proyecto CORBEL.
Estamos agradecidos de que CORBEL pudiera atraer a Provital como usuario, y esperamos que este ejemplo de colaboración fructífera entre las infraestructuras y un usuario de la industria anime a nuevos socios de la industria a acceder a nuestros servicios.
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